Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXF1Q12946 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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