Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms