Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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