Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms