Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms