Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms