Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ERCC6Q03468 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms