Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CBX1P83916 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CBX1P83916 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX1P83916 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX1P83916 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX1P83916 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX1P83916 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CBX1P83916 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CBX1P83916 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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