Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HBBP68871 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HBBP68871 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms