Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AQP4P55087 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AQP4P55087 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms