Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms