Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA2D1P54289 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms