Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
AP3M2P53677 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms