Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA4P51532 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCA4P51532 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms