Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM23P36406 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms