Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTNNA2P26232 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms