Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TAF1P21675 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TAF1P21675 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms