Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms