Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TOP2AP11388 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOP2AP11388 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms