Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB1P08034 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms