Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEFLP07196 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEFLP07196 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEFLP07196 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEFLP07196 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms