Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGB2P05107 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGB2P05107 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms