Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms