Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTNBO60941 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTNBO60941 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTNBO60941 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTNBO60941 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DTNBO60941 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DTNBO60941 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DTNBO60941 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms