Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TLX3O43711 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms