Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNPHO15079 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNPHO15079 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNPHO15079 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNPHO15079 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNPHO15079 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNPHO15079 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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SNPHO15079 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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