Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms