Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
ARID3CA6NKF2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARID3CA6NKF2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms