Protein–RNA interactions for Protein: S4R3C0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S4R3C0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
S4R3C0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
S4R3C0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
S4R3C0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
S4R3C0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
S4R3C0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
S4R3C0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
S4R3C0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
S4R3C0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
S4R3C0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
S4R3C0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
S4R3C0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
S4R3C0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
S4R3C0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
S4R3C0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms