Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVW-1Q9UQF0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVW-1Q9UQF0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms