Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNB3Q9ULL4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLXNB3Q9ULL4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLXNB3Q9ULL4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms