Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNMA3Q9UL41 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNMA3Q9UL41 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNMA3Q9UL41 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNMA3Q9UL41 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms