Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LAMTOR3Q9UHA4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LAMTOR3Q9UHA4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMTOR3Q9UHA4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1897 ms