Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE7Q9UBL6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPNE7Q9UBL6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms