Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIGD1BQ9P298 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HIGD1BQ9P298 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HIGD1BQ9P298 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms