Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS18Q9P253 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VPS18Q9P253 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS18Q9P253 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms