Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MYOFQ9NZM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYOFQ9NZM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MYOFQ9NZM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms