Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD4Q9NXE4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPD4Q9NXE4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPD4Q9NXE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms