Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB20Q9NX57 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB20Q9NX57 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB20Q9NX57 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms