Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLE1Q9NVX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLE1Q9NVX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NLE1Q9NVX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms