Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CISHQ9NSE2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CISHQ9NSE2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CISHQ9NSE2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms