Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSU72Q9NP77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSU72Q9NP77 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms