Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SP110Q9HB58 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SP110Q9HB58 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SP110Q9HB58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms