Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF3Q9H4D5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NXF3Q9H4D5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NXF3Q9H4D5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms