Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIF3L1Q9GZT8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIF3L1Q9GZT8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms