Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF3Q9GZM5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YIPF3Q9GZM5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIPF3Q9GZM5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms