Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC39A8Q9C0K1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC39A8Q9C0K1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC39A8Q9C0K1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms