Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
THSD7BQ9C0I4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THSD7BQ9C0I4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THSD7BQ9C0I4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THSD7BQ9C0I4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms