Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
INO80BQ9C086 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80BQ9C086 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms