Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA9Q9BWV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA9Q9BWV2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA9Q9BWV2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA9Q9BWV2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA9Q9BWV2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA9Q9BWV2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA9Q9BWV2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms